Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPAP53621 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPAP53621 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPAP53621 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPAP53621 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPAP53621 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPAP53621 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COPAP53621 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPAP53621 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPAP53621 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPAP53621 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPAP53621 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPAP53621 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPAP53621 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPAP53621 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COPAP53621 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPAP53621 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPAP53621 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COPAP53621 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPAP53621 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COPAP53621 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COPAP53621 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPAP53621 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPAP53621 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPAP53621 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPAP53621 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPAP53621 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPAP53621 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPAP53621 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPAP53621 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPAP53621 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPAP53621 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPAP53621 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPAP53621 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPAP53621 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COPAP53621 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPAP53621 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPAP53621 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPAP53621 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COPAP53621 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COPAP53621 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPAP53621 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPAP53621 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPAP53621 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPAP53621 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COPAP53621 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPAP53621 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPAP53621 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COPAP53621 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPAP53621 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPAP53621 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPAP53621 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPAP53621 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPAP53621 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPAP53621 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPAP53621 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COPAP53621 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPAP53621 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPAP53621 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPAP53621 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COPAP53621 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPAP53621 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPAP53621 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPAP53621 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPAP53621 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COPAP53621 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPAP53621 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPAP53621 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPAP53621 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPAP53621 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPAP53621 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPAP53621 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPAP53621 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPAP53621 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPAP53621 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COPAP53621 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPAP53621 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPAP53621 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPAP53621 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPAP53621 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPAP53621 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPAP53621 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPAP53621 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPAP53621 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPAP53621 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPAP53621 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COPAP53621 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPAP53621 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPAP53621 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPAP53621 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPAP53621 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPAP53621 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPAP53621 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPAP53621 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPAP53621 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPAP53621 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPAP53621 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPAP53621 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPAP53621 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPAP53621 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms