Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACLYP53396 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACLYP53396 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACLYP53396 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACLYP53396 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACLYP53396 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACLYP53396 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACLYP53396 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACLYP53396 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACLYP53396 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACLYP53396 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACLYP53396 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACLYP53396 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACLYP53396 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACLYP53396 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACLYP53396 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ACLYP53396 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACLYP53396 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACLYP53396 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACLYP53396 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACLYP53396 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACLYP53396 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACLYP53396 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACLYP53396 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACLYP53396 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACLYP53396 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACLYP53396 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACLYP53396 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACLYP53396 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACLYP53396 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACLYP53396 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACLYP53396 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ACLYP53396 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACLYP53396 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACLYP53396 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACLYP53396 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACLYP53396 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACLYP53396 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACLYP53396 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACLYP53396 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACLYP53396 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ACLYP53396 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACLYP53396 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ACLYP53396 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACLYP53396 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACLYP53396 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACLYP53396 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACLYP53396 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACLYP53396 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ACLYP53396 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACLYP53396 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACLYP53396 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACLYP53396 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACLYP53396 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACLYP53396 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACLYP53396 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACLYP53396 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACLYP53396 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACLYP53396 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACLYP53396 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACLYP53396 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACLYP53396 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACLYP53396 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACLYP53396 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACLYP53396 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACLYP53396 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACLYP53396 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACLYP53396 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACLYP53396 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACLYP53396 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACLYP53396 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACLYP53396 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACLYP53396 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACLYP53396 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ACLYP53396 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ACLYP53396 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACLYP53396 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACLYP53396 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACLYP53396 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ACLYP53396 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACLYP53396 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACLYP53396 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACLYP53396 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACLYP53396 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACLYP53396 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACLYP53396 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACLYP53396 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACLYP53396 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACLYP53396 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACLYP53396 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACLYP53396 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACLYP53396 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACLYP53396 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACLYP53396 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACLYP53396 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACLYP53396 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACLYP53396 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACLYP53396 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACLYP53396 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ACLYP53396 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms