Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HK3P52790 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HK3P52790 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HK3P52790 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HK3P52790 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HK3P52790 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HK3P52790 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HK3P52790 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HK3P52790 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HK3P52790 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HK3P52790 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HK3P52790 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HK3P52790 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HK3P52790 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HK3P52790 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HK3P52790 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HK3P52790 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HK3P52790 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HK3P52790 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HK3P52790 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HK3P52790 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HK3P52790 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HK3P52790 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HK3P52790 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HK3P52790 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HK3P52790 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HK3P52790 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HK3P52790 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HK3P52790 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HK3P52790 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HK3P52790 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HK3P52790 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HK3P52790 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HK3P52790 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HK3P52790 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HK3P52790 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HK3P52790 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HK3P52790 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HK3P52790 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HK3P52790 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HK3P52790 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HK3P52790 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HK3P52790 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HK3P52790 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HK3P52790 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HK3P52790 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HK3P52790 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HK3P52790 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HK3P52790 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HK3P52790 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HK3P52790 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HK3P52790 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HK3P52790 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HK3P52790 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HK3P52790 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HK3P52790 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HK3P52790 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HK3P52790 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HK3P52790 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HK3P52790 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HK3P52790 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HK3P52790 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HK3P52790 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HK3P52790 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HK3P52790 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HK3P52790 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HK3P52790 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HK3P52790 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HK3P52790 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HK3P52790 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HK3P52790 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HK3P52790 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HK3P52790 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HK3P52790 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HK3P52790 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HK3P52790 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HK3P52790 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HK3P52790 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HK3P52790 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HK3P52790 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HK3P52790 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HK3P52790 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HK3P52790 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HK3P52790 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HK3P52790 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HK3P52790 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HK3P52790 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HK3P52790 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HK3P52790 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HK3P52790 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HK3P52790 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HK3P52790 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HK3P52790 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HK3P52790 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HK3P52790 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HK3P52790 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HK3P52790 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HK3P52790 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HK3P52790 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HK3P52790 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms