Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2JP52435 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2JP52435 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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