Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCNKBP51801 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLCNKBP51801 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLCNKBP51801 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms