Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC40.88■■■■■ 4.14
SMARCA4P51532 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC40.85■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC40.82■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC40.82■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
SMARCA4P51532 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC40.82■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
SMARCA4P51532 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms