Protein–RNA interactions for Protein: P49754

VPS41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS41P49754 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS41P49754 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS41P49754 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS41P49754 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS41P49754 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS41P49754 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS41P49754 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS41P49754 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS41P49754 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS41P49754 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS41P49754 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS41P49754 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS41P49754 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS41P49754 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS41P49754 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS41P49754 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS41P49754 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS41P49754 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS41P49754 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS41P49754 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS41P49754 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS41P49754 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS41P49754 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS41P49754 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS41P49754 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS41P49754 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS41P49754 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS41P49754 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS41P49754 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS41P49754 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS41P49754 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS41P49754 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS41P49754 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS41P49754 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS41P49754 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS41P49754 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS41P49754 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS41P49754 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS41P49754 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS41P49754 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS41P49754 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS41P49754 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS41P49754 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS41P49754 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS41P49754 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS41P49754 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS41P49754 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS41P49754 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS41P49754 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS41P49754 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS41P49754 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS41P49754 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS41P49754 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VPS41P49754 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS41P49754 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS41P49754 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS41P49754 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS41P49754 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS41P49754 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS41P49754 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS41P49754 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS41P49754 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS41P49754 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS41P49754 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS41P49754 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS41P49754 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS41P49754 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VPS41P49754 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS41P49754 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS41P49754 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
VPS41P49754 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS41P49754 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS41P49754 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS41P49754 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS41P49754 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS41P49754 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS41P49754 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS41P49754 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS41P49754 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS41P49754 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS41P49754 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS41P49754 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS41P49754 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VPS41P49754 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS41P49754 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS41P49754 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS41P49754 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS41P49754 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS41P49754 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS41P49754 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS41P49754 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VPS41P49754 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS41P49754 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS41P49754 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS41P49754 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS41P49754 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS41P49754 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS41P49754 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS41P49754 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VPS41P49754 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms