Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRIM1P49642 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PRIM1P49642 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms