Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
AMPHP49418 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
AMPHP49418 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
AMPHP49418 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AMPHP49418 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AMPHP49418 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AMPHP49418 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AMPHP49418 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AMPHP49418 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AMPHP49418 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AMPHP49418 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AMPHP49418 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AMPHP49418 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
AMPHP49418 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
AMPHP49418 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
AMPHP49418 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
AMPHP49418 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AMPHP49418 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
AMPHP49418 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AMPHP49418 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
AMPHP49418 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
AMPHP49418 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
AMPHP49418 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
AMPHP49418 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
AMPHP49418 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
AMPHP49418 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
AMPHP49418 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
AMPHP49418 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
AMPHP49418 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
AMPHP49418 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
AMPHP49418 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
AMPHP49418 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
AMPHP49418 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
AMPHP49418 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
AMPHP49418 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
AMPHP49418 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
AMPHP49418 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
AMPHP49418 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
AMPHP49418 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
AMPHP49418 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
AMPHP49418 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
AMPHP49418 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
AMPHP49418 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
AMPHP49418 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
AMPHP49418 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
AMPHP49418 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
AMPHP49418 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
AMPHP49418 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
AMPHP49418 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
AMPHP49418 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
AMPHP49418 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
AMPHP49418 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
AMPHP49418 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
AMPHP49418 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
AMPHP49418 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
AMPHP49418 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
AMPHP49418 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
AMPHP49418 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
AMPHP49418 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
AMPHP49418 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
AMPHP49418 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
AMPHP49418 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
AMPHP49418 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
AMPHP49418 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
AMPHP49418 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
AMPHP49418 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
AMPHP49418 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
AMPHP49418 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
AMPHP49418 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
AMPHP49418 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
AMPHP49418 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
AMPHP49418 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
AMPHP49418 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
AMPHP49418 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
AMPHP49418 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
AMPHP49418 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
AMPHP49418 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
AMPHP49418 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
AMPHP49418 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
AMPHP49418 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
AMPHP49418 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
AMPHP49418 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
AMPHP49418 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
AMPHP49418 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
AMPHP49418 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
AMPHP49418 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
AMPHP49418 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
AMPHP49418 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
AMPHP49418 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
AMPHP49418 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
AMPHP49418 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
AMPHP49418 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
AMPHP49418 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
AMPHP49418 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
AMPHP49418 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
AMPHP49418 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
AMPHP49418 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
AMPHP49418 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
AMPHP49418 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
AMPHP49418 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms