Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC11A1P49279 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC11A1P49279 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC11A1P49279 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms