Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC1A6P48664 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC1A6P48664 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC1A6P48664 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms