Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCLMP48507 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCLMP48507 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCLMP48507 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCLMP48507 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCLMP48507 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCLMP48507 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCLMP48507 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCLMP48507 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCLMP48507 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GCLMP48507 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCLMP48507 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLMP48507 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLMP48507 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLMP48507 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLMP48507 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLMP48507 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLMP48507 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLMP48507 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLMP48507 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCLMP48507 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLMP48507 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLMP48507 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLMP48507 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLMP48507 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLMP48507 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLMP48507 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLMP48507 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLMP48507 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLMP48507 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLMP48507 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLMP48507 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLMP48507 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCLMP48507 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCLMP48507 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCLMP48507 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCLMP48507 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCLMP48507 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCLMP48507 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLMP48507 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLMP48507 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLMP48507 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLMP48507 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLMP48507 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLMP48507 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLMP48507 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLMP48507 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLMP48507 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCLMP48507 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLMP48507 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLMP48507 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLMP48507 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLMP48507 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLMP48507 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLMP48507 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLMP48507 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLMP48507 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLMP48507 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLMP48507 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCLMP48507 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCLMP48507 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCLMP48507 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCLMP48507 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCLMP48507 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCLMP48507 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCLMP48507 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCLMP48507 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCLMP48507 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GCLMP48507 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLMP48507 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLMP48507 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLMP48507 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLMP48507 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLMP48507 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLMP48507 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLMP48507 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLMP48507 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLMP48507 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLMP48507 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCLMP48507 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLMP48507 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLMP48507 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLMP48507 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLMP48507 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLMP48507 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLMP48507 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLMP48507 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLMP48507 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLMP48507 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLMP48507 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLMP48507 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLMP48507 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLMP48507 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLMP48507 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLMP48507 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLMP48507 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLMP48507 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLMP48507 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLMP48507 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLMP48507 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms