Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA4P48169 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABRA4P48169 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABRA4P48169 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABRA4P48169 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GABRA4P48169 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA4P48169 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA4P48169 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA4P48169 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA4P48169 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GABRA4P48169 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA4P48169 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA4P48169 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA4P48169 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA4P48169 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA4P48169 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA4P48169 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA4P48169 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA4P48169 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GABRA4P48169 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA4P48169 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA4P48169 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA4P48169 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA4P48169 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA4P48169 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA4P48169 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA4P48169 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA4P48169 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA4P48169 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA4P48169 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA4P48169 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA4P48169 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA4P48169 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA4P48169 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA4P48169 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GABRA4P48169 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GABRA4P48169 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA4P48169 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA4P48169 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA4P48169 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA4P48169 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA4P48169 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA4P48169 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA4P48169 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA4P48169 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA4P48169 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA4P48169 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA4P48169 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA4P48169 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA4P48169 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA4P48169 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA4P48169 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA4P48169 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA4P48169 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA4P48169 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA4P48169 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA4P48169 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA4P48169 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GABRA4P48169 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA4P48169 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA4P48169 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA4P48169 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA4P48169 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GABRA4P48169 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA4P48169 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA4P48169 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GABRA4P48169 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GABRA4P48169 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA4P48169 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA4P48169 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms