Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC6A11P48066 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC6A11P48066 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms