Protein–RNA interactions for Protein: P46059

SLC15A1, Solute carrier family 15 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC15A1P46059 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC15A1P46059 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC15A1P46059 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms