Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSFMP43897 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSFMP43897 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSFMP43897 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSFMP43897 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSFMP43897 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSFMP43897 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSFMP43897 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSFMP43897 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSFMP43897 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSFMP43897 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSFMP43897 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSFMP43897 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSFMP43897 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSFMP43897 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSFMP43897 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSFMP43897 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSFMP43897 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSFMP43897 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSFMP43897 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TSFMP43897 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSFMP43897 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSFMP43897 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSFMP43897 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSFMP43897 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSFMP43897 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSFMP43897 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSFMP43897 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSFMP43897 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSFMP43897 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSFMP43897 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TSFMP43897 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSFMP43897 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSFMP43897 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSFMP43897 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSFMP43897 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSFMP43897 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSFMP43897 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSFMP43897 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSFMP43897 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSFMP43897 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSFMP43897 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSFMP43897 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TSFMP43897 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSFMP43897 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSFMP43897 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSFMP43897 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSFMP43897 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSFMP43897 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSFMP43897 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSFMP43897 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSFMP43897 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSFMP43897 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSFMP43897 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSFMP43897 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSFMP43897 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSFMP43897 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSFMP43897 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSFMP43897 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSFMP43897 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSFMP43897 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSFMP43897 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSFMP43897 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSFMP43897 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TSFMP43897 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSFMP43897 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSFMP43897 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSFMP43897 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSFMP43897 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSFMP43897 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSFMP43897 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSFMP43897 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSFMP43897 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSFMP43897 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSFMP43897 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSFMP43897 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TSFMP43897 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSFMP43897 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSFMP43897 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSFMP43897 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSFMP43897 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TSFMP43897 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSFMP43897 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSFMP43897 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TSFMP43897 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSFMP43897 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSFMP43897 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSFMP43897 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSFMP43897 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSFMP43897 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSFMP43897 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSFMP43897 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSFMP43897 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSFMP43897 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSFMP43897 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSFMP43897 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSFMP43897 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSFMP43897 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSFMP43897 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSFMP43897 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms