Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MCAMP43121 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCAMP43121 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCAMP43121 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MCAMP43121 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCAMP43121 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MCAMP43121 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCAMP43121 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MCAMP43121 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MCAMP43121 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCAMP43121 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCAMP43121 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCAMP43121 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCAMP43121 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCAMP43121 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCAMP43121 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCAMP43121 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCAMP43121 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCAMP43121 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCAMP43121 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCAMP43121 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCAMP43121 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCAMP43121 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCAMP43121 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCAMP43121 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCAMP43121 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCAMP43121 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCAMP43121 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCAMP43121 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCAMP43121 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCAMP43121 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCAMP43121 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCAMP43121 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCAMP43121 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCAMP43121 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCAMP43121 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCAMP43121 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCAMP43121 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCAMP43121 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCAMP43121 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCAMP43121 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCAMP43121 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCAMP43121 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCAMP43121 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCAMP43121 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MCAMP43121 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MCAMP43121 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCAMP43121 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCAMP43121 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCAMP43121 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCAMP43121 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MCAMP43121 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCAMP43121 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCAMP43121 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCAMP43121 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCAMP43121 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCAMP43121 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCAMP43121 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCAMP43121 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCAMP43121 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCAMP43121 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCAMP43121 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCAMP43121 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MCAMP43121 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCAMP43121 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCAMP43121 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCAMP43121 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCAMP43121 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCAMP43121 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCAMP43121 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCAMP43121 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCAMP43121 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCAMP43121 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCAMP43121 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCAMP43121 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCAMP43121 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MCAMP43121 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MCAMP43121 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCAMP43121 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCAMP43121 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCAMP43121 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCAMP43121 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCAMP43121 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCAMP43121 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCAMP43121 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCAMP43121 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MCAMP43121 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MCAMP43121 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCAMP43121 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCAMP43121 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCAMP43121 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCAMP43121 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCAMP43121 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCAMP43121 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCAMP43121 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCAMP43121 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCAMP43121 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCAMP43121 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCAMP43121 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCAMP43121 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms