Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTGIRP43119 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGIRP43119 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms