Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A1P43005 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC1A1P43005 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A1P43005 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms