Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC26A3P40879 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC26A3P40879 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms