Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 FDC1YDR539W 1512 nt4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 FLO8YER109C 2400 nt4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 SOL4YGR248W 768 nt4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 YHL049CYHL049C 816 nt4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 TDA11YHR159W 1515 nt4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 FRT2YAL028W 1587 nt4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 ISA1YLL027W 753 nt4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 YLR125WYLR125W 411 nt4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 CLB4YLR210W 1383 nt4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 SUI1YNL244C 327 nt4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 YDC1YPL087W 954 nt4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 TRE1YPL176C 2352 nt4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 YPL260WYPL260W 1656 nt4.59□□□□□ -1.67
SHQ1P40486 GDE1YPL110C 3672 nt4.59□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 VAC7YNL054W 3498 nt4.59□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 LDB17YDL146W 1476 nt4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 COS6YGR295C 1146 nt4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 YIL171WYIL171W 330 nt4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 CNB1YKL190W 528 nt4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 GRC3YLL035W 1899 nt4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 BUD8YLR353W 1812 nt4.58□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 LAS1YKR063C 1509 nt4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 FOX2YKR009C 2703 nt4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 FRA2YGL220W 363 nt4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 YGR269WYGR269W 327 nt4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 ISY1YJR050W 708 nt4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 RDN5-1RDN5-1 121 nt4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 RDN5-6RDN5-6 121 nt4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 AZR1YGR224W 1842 nt4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 HFA1YMR207C 6372 nt4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 TRM44YPL030W 1704 nt4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 ECM32YER176W 3366 nt4.57□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 STB3YDR169C 1542 nt4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 DIT2YDR402C 1470 nt4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 PDR12YPL058C 4536 nt4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 SBE2YDR351W 2595 nt4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 YDL124WYDL124W 939 nt4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 RPL24AYGL031C 468 nt4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 PHM7YOL084W 2976 nt4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 YOR379CYOR379C 339 nt4.56□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 MDM34YGL219C 1380 nt4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 BRE4YDL231C 3378 nt4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 ARC1YGL105W 1131 nt4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 FMP46YKR049C 402 nt4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 TAF11YML015C 1041 nt4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 RER1YCL001W 567 nt4.55□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 SKM1YOL113W 1968 nt4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 GCR1YPL075W 2358 nt4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 PRE9YGR135W 777 nt4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 NVJ1YHR195W 966 nt4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 CSM2YIL132C 642 nt4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 YMR082CYMR082C 357 nt4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 RRP40YOL142W 723 nt4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 HEM15YOR176W 1182 nt4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 snR3snR3 194 nt4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 VPS73YGL104C 1461 nt4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 SSH1YBR283C 1473 nt4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 DIT1YDR403W 1611 nt4.54□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 MST1YKL194C 1389 nt4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 SMP1YBR182C 1359 nt4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 ORC6YHR118C 1308 nt4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 WTM1YOR230W 1314 nt4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 GDH2YDL215C 3279 nt4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 ARP10YDR106W 855 nt4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 SPC34YKR037C 888 nt4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 OSW5YMR148W 447 nt4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 SPN1YPR133C 1233 nt4.53□□□□□ -1.68
SHQ1P40486 PRP28YDR243C 1767 nt4.53□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 ARG4YHR018C 1392 nt4.53□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 TPA1YER049W 1935 nt4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 SUL2YLR092W 2682 nt4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 IBA57YJR122W 1494 nt4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 RRT7YLL030C 342 nt4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 RPL15BYMR121C 615 nt4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 PDX3YBR035C 687 nt4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 SRB6YBR253W 366 nt4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 TIF4632YGL049C 2745 nt4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 PHO84YML123C 1764 nt4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 YOL153CYOL153C 1746 nt4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 RAD57YDR004W 1383 nt4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 SNF2YOR290C 5112 nt4.52□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 MEF2YJL102W 2460 nt4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 RPS4BYHR203C 786 nt4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 RPS4AYJR145C 786 nt4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 RPL14AYKL006W 417 nt4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 PML1YLR016C 615 nt4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt4.51□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 YCF1YDR135C 4548 nt4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 ADP1YCR011C 3150 nt4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 RAM1YDL090C 1296 nt4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 YGL088WYGL088W 366 nt4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 CUS2YNL286W 858 nt4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 CDC48YDL126C 2508 nt4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 ADY3YDL239C 2373 nt4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 SKG6YHR149C 2205 nt4.5□□□□□ -1.69
SHQ1P40486 MMR1YLR190W 1476 nt4.49□□□□□ -1.69
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