Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX2P40425 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX2P40425 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX2P40425 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX2P40425 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX2P40425 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX2P40425 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX2P40425 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX2P40425 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX2P40425 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX2P40425 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX2P40425 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX2P40425 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX2P40425 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PBX2P40425 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX2P40425 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX2P40425 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX2P40425 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX2P40425 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX2P40425 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX2P40425 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX2P40425 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX2P40425 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX2P40425 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX2P40425 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PBX2P40425 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PBX2P40425 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX2P40425 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX2P40425 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX2P40425 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX2P40425 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX2P40425 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX2P40425 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PBX2P40425 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX2P40425 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX2P40425 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX2P40425 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX2P40425 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX2P40425 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX2P40425 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX2P40425 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX2P40425 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX2P40425 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX2P40425 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PBX2P40425 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX2P40425 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX2P40425 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX2P40425 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX2P40425 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX2P40425 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX2P40425 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX2P40425 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX2P40425 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX2P40425 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX2P40425 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PBX2P40425 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX2P40425 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX2P40425 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX2P40425 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX2P40425 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX2P40425 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX2P40425 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX2P40425 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PBX2P40425 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX2P40425 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX2P40425 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX2P40425 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX2P40425 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX2P40425 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX2P40425 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX2P40425 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX2P40425 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PBX2P40425 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX2P40425 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX2P40425 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX2P40425 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX2P40425 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX2P40425 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX2P40425 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PBX2P40425 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PBX2P40425 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX2P40425 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX2P40425 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX2P40425 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX2P40425 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX2P40425 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX2P40425 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX2P40425 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PBX2P40425 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX2P40425 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX2P40425 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX2P40425 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX2P40425 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX2P40425 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX2P40425 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX2P40425 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PBX2P40425 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX2P40425 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX2P40425 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PBX2P40425 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms