Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DSG3P32926 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG3P32926 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG3P32926 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG3P32926 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG3P32926 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DSG3P32926 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DSG3P32926 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DSG3P32926 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DSG3P32926 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DSG3P32926 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DSG3P32926 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DSG3P32926 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DSG3P32926 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSG3P32926 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSG3P32926 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSG3P32926 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSG3P32926 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSG3P32926 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DSG3P32926 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG3P32926 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG3P32926 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG3P32926 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG3P32926 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG3P32926 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG3P32926 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG3P32926 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG3P32926 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG3P32926 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG3P32926 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DSG3P32926 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG3P32926 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG3P32926 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG3P32926 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG3P32926 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG3P32926 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG3P32926 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG3P32926 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG3P32926 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG3P32926 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG3P32926 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG3P32926 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG3P32926 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG3P32926 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG3P32926 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG3P32926 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DSG3P32926 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG3P32926 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG3P32926 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG3P32926 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG3P32926 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG3P32926 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG3P32926 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG3P32926 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG3P32926 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG3P32926 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG3P32926 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DSG3P32926 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG3P32926 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG3P32926 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG3P32926 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG3P32926 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG3P32926 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG3P32926 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG3P32926 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG3P32926 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG3P32926 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG3P32926 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG3P32926 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG3P32926 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG3P32926 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG3P32926 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DSG3P32926 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG3P32926 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG3P32926 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG3P32926 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG3P32926 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG3P32926 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG3P32926 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG3P32926 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG3P32926 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DSG3P32926 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms