Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CXCR5P32302 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CXCR5P32302 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CXCR5P32302 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms