Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRS3P32247 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRS3P32247 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRS3P32247 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRS3P32247 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRS3P32247 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRS3P32247 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRS3P32247 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRS3P32247 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRS3P32247 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRS3P32247 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRS3P32247 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRS3P32247 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRS3P32247 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRS3P32247 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRS3P32247 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRS3P32247 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRS3P32247 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRS3P32247 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRS3P32247 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRS3P32247 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRS3P32247 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRS3P32247 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRS3P32247 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRS3P32247 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRS3P32247 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRS3P32247 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRS3P32247 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRS3P32247 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRS3P32247 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRS3P32247 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRS3P32247 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRS3P32247 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRS3P32247 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRS3P32247 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRS3P32247 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRS3P32247 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRS3P32247 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRS3P32247 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRS3P32247 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRS3P32247 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRS3P32247 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRS3P32247 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRS3P32247 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRS3P32247 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRS3P32247 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRS3P32247 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRS3P32247 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRS3P32247 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRS3P32247 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRS3P32247 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRS3P32247 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRS3P32247 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BRS3P32247 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRS3P32247 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRS3P32247 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRS3P32247 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRS3P32247 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRS3P32247 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRS3P32247 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRS3P32247 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRS3P32247 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRS3P32247 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRS3P32247 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BRS3P32247 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRS3P32247 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BRS3P32247 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
BRS3P32247 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRS3P32247 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRS3P32247 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRS3P32247 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRS3P32247 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRS3P32247 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRS3P32247 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRS3P32247 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRS3P32247 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRS3P32247 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRS3P32247 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BRS3P32247 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRS3P32247 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRS3P32247 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRS3P32247 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRS3P32247 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRS3P32247 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRS3P32247 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRS3P32247 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRS3P32247 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRS3P32247 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRS3P32247 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRS3P32247 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BRS3P32247 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRS3P32247 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRS3P32247 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRS3P32247 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRS3P32247 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRS3P32247 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BRS3P32247 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRS3P32247 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRS3P32247 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BRS3P32247 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms