Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
L1CAMP32004 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
L1CAMP32004 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
L1CAMP32004 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms