Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC8P31273 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC8P31273 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms