Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-FP30511 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-FP30511 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms