Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIPP30301 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIPP30301 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIPP30301 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIPP30301 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIPP30301 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIPP30301 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIPP30301 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIPP30301 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MIPP30301 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIPP30301 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIPP30301 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIPP30301 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIPP30301 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIPP30301 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIPP30301 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIPP30301 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIPP30301 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIPP30301 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIPP30301 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIPP30301 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIPP30301 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIPP30301 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIPP30301 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MIPP30301 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MIPP30301 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MIPP30301 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MIPP30301 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIPP30301 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIPP30301 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPP30301 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPP30301 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPP30301 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPP30301 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPP30301 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPP30301 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPP30301 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPP30301 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPP30301 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPP30301 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPP30301 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIPP30301 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPP30301 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPP30301 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPP30301 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPP30301 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPP30301 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPP30301 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPP30301 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPP30301 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPP30301 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPP30301 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIPP30301 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MIPP30301 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIPP30301 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIPP30301 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIPP30301 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIPP30301 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIPP30301 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIPP30301 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIPP30301 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIPP30301 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIPP30301 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIPP30301 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIPP30301 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIPP30301 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIPP30301 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIPP30301 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIPP30301 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIPP30301 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIPP30301 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIPP30301 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIPP30301 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIPP30301 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIPP30301 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIPP30301 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MIPP30301 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIPP30301 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIPP30301 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIPP30301 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIPP30301 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIPP30301 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIPP30301 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIPP30301 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIPP30301 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIPP30301 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIPP30301 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIPP30301 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIPP30301 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIPP30301 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIPP30301 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIPP30301 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIPP30301 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIPP30301 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIPP30301 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIPP30301 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIPP30301 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIPP30301 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIPP30301 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIPP30301 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms