Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CD40LGP29965 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CD40LGP29965 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CD40LGP29965 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms