Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2E2P29084 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2E2P29084 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2E2P29084 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2E2P29084 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2E2P29084 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GTF2E2P29084 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2E2P29084 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2E2P29084 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2E2P29084 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2E2P29084 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2E2P29084 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2E2P29084 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GTF2E2P29084 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF2E2P29084 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF2E2P29084 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF2E2P29084 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GTF2E2P29084 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GTF2E2P29084 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF2E2P29084 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms