Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFRSF8P28908 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF8P28908 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms