Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DUSP1P28562 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms