Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
NDUFS1P28331 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDUFS1P28331 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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