Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTFP26441 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTFP26441 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTFP26441 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTFP26441 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTFP26441 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTFP26441 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTFP26441 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTFP26441 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTFP26441 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTFP26441 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTFP26441 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTFP26441 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTFP26441 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTFP26441 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTFP26441 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTFP26441 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTFP26441 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTFP26441 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTFP26441 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTFP26441 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTFP26441 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTFP26441 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTFP26441 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTFP26441 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTFP26441 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTFP26441 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTFP26441 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTFP26441 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTFP26441 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTFP26441 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTFP26441 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTFP26441 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTFP26441 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTFP26441 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTFP26441 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTFP26441 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTFP26441 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTFP26441 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTFP26441 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTFP26441 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTFP26441 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTFP26441 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTFP26441 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTFP26441 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTFP26441 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTFP26441 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTFP26441 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTFP26441 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTFP26441 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTFP26441 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTFP26441 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTFP26441 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTFP26441 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTFP26441 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTFP26441 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTFP26441 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTFP26441 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTFP26441 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTFP26441 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTFP26441 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTFP26441 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTFP26441 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTFP26441 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTFP26441 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTFP26441 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTFP26441 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTFP26441 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTFP26441 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTFP26441 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTFP26441 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTFP26441 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTFP26441 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTFP26441 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTFP26441 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTFP26441 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTFP26441 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTFP26441 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTFP26441 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTFP26441 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTFP26441 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTFP26441 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTFP26441 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTFP26441 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTFP26441 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTFP26441 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTFP26441 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTFP26441 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTFP26441 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTFP26441 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTFP26441 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTFP26441 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTFP26441 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTFP26441 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTFP26441 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTFP26441 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTFP26441 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTFP26441 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTFP26441 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTFP26441 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms