Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME2P23368 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME2P23368 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME2P23368 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME2P23368 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME2P23368 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME2P23368 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME2P23368 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME2P23368 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME2P23368 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME2P23368 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME2P23368 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME2P23368 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME2P23368 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ME2P23368 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME2P23368 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME2P23368 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME2P23368 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME2P23368 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME2P23368 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ME2P23368 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME2P23368 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME2P23368 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME2P23368 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME2P23368 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME2P23368 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME2P23368 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ME2P23368 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME2P23368 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME2P23368 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME2P23368 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME2P23368 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME2P23368 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME2P23368 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME2P23368 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME2P23368 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME2P23368 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME2P23368 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME2P23368 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME2P23368 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ME2P23368 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME2P23368 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME2P23368 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME2P23368 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ME2P23368 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME2P23368 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME2P23368 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME2P23368 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME2P23368 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME2P23368 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME2P23368 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ME2P23368 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ME2P23368 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME2P23368 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME2P23368 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ME2P23368 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME2P23368 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME2P23368 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME2P23368 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME2P23368 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME2P23368 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME2P23368 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME2P23368 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME2P23368 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME2P23368 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ME2P23368 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME2P23368 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME2P23368 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME2P23368 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME2P23368 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ME2P23368 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME2P23368 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME2P23368 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME2P23368 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME2P23368 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME2P23368 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME2P23368 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME2P23368 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ME2P23368 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME2P23368 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME2P23368 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME2P23368 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME2P23368 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME2P23368 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ME2P23368 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME2P23368 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME2P23368 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME2P23368 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME2P23368 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME2P23368 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME2P23368 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME2P23368 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME2P23368 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME2P23368 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME2P23368 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME2P23368 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME2P23368 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME2P23368 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME2P23368 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ME2P23368 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms