Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BGNP21810 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BGNP21810 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BGNP21810 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BGNP21810 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BGNP21810 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BGNP21810 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BGNP21810 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BGNP21810 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BGNP21810 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BGNP21810 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BGNP21810 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BGNP21810 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BGNP21810 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BGNP21810 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BGNP21810 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BGNP21810 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BGNP21810 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BGNP21810 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BGNP21810 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BGNP21810 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BGNP21810 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BGNP21810 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BGNP21810 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BGNP21810 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BGNP21810 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BGNP21810 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BGNP21810 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BGNP21810 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BGNP21810 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BGNP21810 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BGNP21810 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BGNP21810 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BGNP21810 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BGNP21810 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BGNP21810 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BGNP21810 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BGNP21810 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BGNP21810 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BGNP21810 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BGNP21810 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BGNP21810 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BGNP21810 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BGNP21810 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BGNP21810 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BGNP21810 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BGNP21810 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BGNP21810 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BGNP21810 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BGNP21810 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BGNP21810 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BGNP21810 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BGNP21810 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BGNP21810 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BGNP21810 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BGNP21810 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BGNP21810 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BGNP21810 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BGNP21810 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BGNP21810 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BGNP21810 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BGNP21810 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BGNP21810 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BGNP21810 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BGNP21810 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BGNP21810 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BGNP21810 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BGNP21810 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BGNP21810 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BGNP21810 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BGNP21810 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BGNP21810 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BGNP21810 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BGNP21810 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BGNP21810 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BGNP21810 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BGNP21810 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BGNP21810 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BGNP21810 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BGNP21810 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BGNP21810 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms