Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK11BP21127 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms