Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRHP20396 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRHP20396 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRHP20396 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TRHP20396 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRHP20396 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRHP20396 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TRHP20396 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRHP20396 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
TRHP20396 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRHP20396 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRHP20396 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TRHP20396 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRHP20396 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRHP20396 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRHP20396 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRHP20396 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRHP20396 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRHP20396 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
TRHP20396 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TRHP20396 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TRHP20396 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TRHP20396 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
TRHP20396 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TRHP20396 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRHP20396 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRHP20396 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRHP20396 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRHP20396 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRHP20396 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
TRHP20396 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRHP20396 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRHP20396 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRHP20396 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRHP20396 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
TRHP20396 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRHP20396 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRHP20396 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TRHP20396 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRHP20396 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRHP20396 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
TRHP20396 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRHP20396 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TRHP20396 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRHP20396 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRHP20396 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
TRHP20396 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRHP20396 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRHP20396 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TRHP20396 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRHP20396 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRHP20396 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRHP20396 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TRHP20396 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRHP20396 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRHP20396 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRHP20396 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRHP20396 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRHP20396 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRHP20396 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TRHP20396 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRHP20396 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRHP20396 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRHP20396 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRHP20396 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRHP20396 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRHP20396 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRHP20396 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRHP20396 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRHP20396 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
TRHP20396 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRHP20396 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRHP20396 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRHP20396 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRHP20396 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRHP20396 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
TRHP20396 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRHP20396 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRHP20396 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TRHP20396 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRHP20396 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRHP20396 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRHP20396 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRHP20396 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRHP20396 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRHP20396 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRHP20396 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRHP20396 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRHP20396 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRHP20396 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRHP20396 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRHP20396 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRHP20396 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRHP20396 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRHP20396 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRHP20396 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRHP20396 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
TRHP20396 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRHP20396 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
TRHP20396 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms