Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NR1D1P20393 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms