Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGCP20142 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGCP20142 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGCP20142 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGCP20142 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGCP20142 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGCP20142 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGCP20142 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGCP20142 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGCP20142 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGCP20142 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGCP20142 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PGCP20142 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGCP20142 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGCP20142 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGCP20142 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGCP20142 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGCP20142 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGCP20142 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGCP20142 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PGCP20142 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGCP20142 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGCP20142 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGCP20142 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGCP20142 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PGCP20142 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PGCP20142 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PGCP20142 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PGCP20142 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PGCP20142 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGCP20142 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGCP20142 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGCP20142 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGCP20142 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PGCP20142 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGCP20142 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGCP20142 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGCP20142 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGCP20142 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGCP20142 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PGCP20142 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGCP20142 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGCP20142 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGCP20142 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGCP20142 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGCP20142 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGCP20142 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGCP20142 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PGCP20142 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGCP20142 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGCP20142 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PGCP20142 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGCP20142 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGCP20142 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGCP20142 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGCP20142 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PGCP20142 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGCP20142 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGCP20142 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGCP20142 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGCP20142 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PGCP20142 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGCP20142 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGCP20142 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGCP20142 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGCP20142 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGCP20142 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGCP20142 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGCP20142 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGCP20142 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGCP20142 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PGCP20142 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGCP20142 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGCP20142 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGCP20142 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGCP20142 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGCP20142 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PGCP20142 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGCP20142 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGCP20142 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PGCP20142 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGCP20142 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGCP20142 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGCP20142 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGCP20142 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGCP20142 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGCP20142 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PGCP20142 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGCP20142 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGCP20142 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGCP20142 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGCP20142 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGCP20142 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGCP20142 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGCP20142 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGCP20142 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGCP20142 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGCP20142 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGCP20142 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PGCP20142 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms