Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATP2B1P20020 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP2B1P20020 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP2B1P20020 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms