Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGAM1P18669 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAM1P18669 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGAM1P18669 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms