Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRAP18433 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PTPRAP18433 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPRAP18433 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
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