Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LBPP18428 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LBPP18428 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LBPP18428 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LBPP18428 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LBPP18428 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LBPP18428 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LBPP18428 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LBPP18428 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LBPP18428 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LBPP18428 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LBPP18428 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LBPP18428 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LBPP18428 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LBPP18428 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LBPP18428 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LBPP18428 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LBPP18428 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LBPP18428 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LBPP18428 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LBPP18428 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LBPP18428 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LBPP18428 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LBPP18428 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LBPP18428 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LBPP18428 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LBPP18428 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LBPP18428 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LBPP18428 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LBPP18428 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LBPP18428 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LBPP18428 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LBPP18428 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LBPP18428 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LBPP18428 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBPP18428 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBPP18428 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBPP18428 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBPP18428 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBPP18428 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBPP18428 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBPP18428 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBPP18428 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBPP18428 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBPP18428 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBPP18428 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBPP18428 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBPP18428 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBPP18428 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBPP18428 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBPP18428 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBPP18428 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBPP18428 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBPP18428 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBPP18428 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBPP18428 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBPP18428 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBPP18428 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBPP18428 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBPP18428 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBPP18428 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms