Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
ITGB4P16144 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGB4P16144 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ITGB4P16144 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms