Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF4P15884 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF4P15884 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF4P15884 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF4P15884 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF4P15884 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF4P15884 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF4P15884 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF4P15884 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF4P15884 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF4P15884 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF4P15884 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF4P15884 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF4P15884 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF4P15884 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF4P15884 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF4P15884 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF4P15884 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCF4P15884 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF4P15884 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF4P15884 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF4P15884 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF4P15884 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF4P15884 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF4P15884 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF4P15884 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF4P15884 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF4P15884 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF4P15884 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF4P15884 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCF4P15884 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF4P15884 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF4P15884 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF4P15884 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF4P15884 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF4P15884 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF4P15884 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF4P15884 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF4P15884 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF4P15884 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF4P15884 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF4P15884 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF4P15884 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCF4P15884 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCF4P15884 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCF4P15884 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCF4P15884 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF4P15884 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF4P15884 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF4P15884 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF4P15884 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF4P15884 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCF4P15884 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF4P15884 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF4P15884 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF4P15884 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF4P15884 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF4P15884 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF4P15884 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCF4P15884 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF4P15884 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF4P15884 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF4P15884 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF4P15884 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF4P15884 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF4P15884 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF4P15884 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCF4P15884 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF4P15884 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF4P15884 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF4P15884 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF4P15884 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF4P15884 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF4P15884 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF4P15884 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF4P15884 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF4P15884 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF4P15884 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF4P15884 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF4P15884 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF4P15884 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF4P15884 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF4P15884 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF4P15884 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF4P15884 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF4P15884 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF4P15884 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF4P15884 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF4P15884 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF4P15884 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF4P15884 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF4P15884 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF4P15884 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF4P15884 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF4P15884 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF4P15884 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF4P15884 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF4P15884 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF4P15884 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF4P15884 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms