Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA3P15088 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA3P15088 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA3P15088 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA3P15088 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA3P15088 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA3P15088 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA3P15088 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA3P15088 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA3P15088 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA3P15088 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA3P15088 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA3P15088 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA3P15088 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA3P15088 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA3P15088 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA3P15088 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA3P15088 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA3P15088 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA3P15088 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA3P15088 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA3P15088 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA3P15088 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA3P15088 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA3P15088 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA3P15088 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA3P15088 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA3P15088 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA3P15088 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA3P15088 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA3P15088 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA3P15088 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA3P15088 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA3P15088 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA3P15088 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA3P15088 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA3P15088 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA3P15088 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA3P15088 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA3P15088 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA3P15088 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA3P15088 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA3P15088 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA3P15088 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA3P15088 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA3P15088 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA3P15088 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA3P15088 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA3P15088 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA3P15088 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA3P15088 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA3P15088 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA3P15088 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA3P15088 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA3P15088 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA3P15088 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA3P15088 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA3P15088 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA3P15088 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA3P15088 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA3P15088 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA3P15088 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA3P15088 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA3P15088 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA3P15088 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA3P15088 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA3P15088 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA3P15088 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA3P15088 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA3P15088 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA3P15088 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPA3P15088 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPA3P15088 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPA3P15088 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPA3P15088 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CPA3P15088 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA3P15088 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA3P15088 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA3P15088 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA3P15088 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA3P15088 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA3P15088 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA3P15088 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA3P15088 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPA3P15088 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA3P15088 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA3P15088 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA3P15088 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA3P15088 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA3P15088 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA3P15088 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA3P15088 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA3P15088 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA3P15088 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA3P15088 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA3P15088 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA3P15088 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA3P15088 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA3P15088 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPA3P15088 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms