Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFAPP14136 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFAPP14136 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFAPP14136 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFAPP14136 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFAPP14136 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFAPP14136 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFAPP14136 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFAPP14136 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFAPP14136 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFAPP14136 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFAPP14136 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFAPP14136 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFAPP14136 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFAPP14136 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GFAPP14136 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFAPP14136 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFAPP14136 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFAPP14136 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFAPP14136 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFAPP14136 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFAPP14136 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFAPP14136 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFAPP14136 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFAPP14136 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFAPP14136 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFAPP14136 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFAPP14136 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFAPP14136 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GFAPP14136 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFAPP14136 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFAPP14136 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFAPP14136 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFAPP14136 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFAPP14136 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFAPP14136 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFAPP14136 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFAPP14136 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GFAPP14136 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFAPP14136 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFAPP14136 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFAPP14136 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFAPP14136 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GFAPP14136 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFAPP14136 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GFAPP14136 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFAPP14136 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GFAPP14136 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GFAPP14136 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFAPP14136 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFAPP14136 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GFAPP14136 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GFAPP14136 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GFAPP14136 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GFAPP14136 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFAPP14136 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFAPP14136 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFAPP14136 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFAPP14136 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFAPP14136 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFAPP14136 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFAPP14136 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFAPP14136 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFAPP14136 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFAPP14136 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GFAPP14136 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFAPP14136 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFAPP14136 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFAPP14136 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFAPP14136 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFAPP14136 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFAPP14136 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFAPP14136 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFAPP14136 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFAPP14136 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFAPP14136 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFAPP14136 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFAPP14136 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFAPP14136 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFAPP14136 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFAPP14136 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GFAPP14136 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFAPP14136 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFAPP14136 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GFAPP14136 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFAPP14136 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFAPP14136 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFAPP14136 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFAPP14136 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFAPP14136 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFAPP14136 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GFAPP14136 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFAPP14136 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFAPP14136 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFAPP14136 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFAPP14136 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFAPP14136 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFAPP14136 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFAPP14136 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GFAPP14136 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms