Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLUP10909 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLUP10909 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLUP10909 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLUP10909 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLUP10909 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLUP10909 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLUP10909 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLUP10909 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLUP10909 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLUP10909 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLUP10909 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLUP10909 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLUP10909 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLUP10909 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLUP10909 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLUP10909 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLUP10909 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLUP10909 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLUP10909 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLUP10909 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLUP10909 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLUP10909 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLUP10909 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLUP10909 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLUP10909 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLUP10909 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLUP10909 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLUP10909 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLUP10909 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLUP10909 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLUP10909 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLUP10909 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLUP10909 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLUP10909 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLUP10909 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUP10909 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUP10909 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUP10909 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUP10909 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUP10909 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUP10909 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUP10909 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUP10909 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUP10909 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUP10909 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUP10909 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUP10909 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUP10909 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUP10909 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUP10909 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUP10909 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUP10909 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLUP10909 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLUP10909 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLUP10909 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLUP10909 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLUP10909 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLUP10909 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLUP10909 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLUP10909 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLUP10909 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLUP10909 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLUP10909 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLUP10909 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLUP10909 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUP10909 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUP10909 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUP10909 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUP10909 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUP10909 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUP10909 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUP10909 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUP10909 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUP10909 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUP10909 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUP10909 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUP10909 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUP10909 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUP10909 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLUP10909 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUP10909 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUP10909 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUP10909 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUP10909 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUP10909 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUP10909 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUP10909 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUP10909 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUP10909 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUP10909 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUP10909 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUP10909 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUP10909 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLUP10909 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLUP10909 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLUP10909 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLUP10909 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLUP10909 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLUP10909 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms